PCR en fenotypische methoden voor de detectie van methicillineresistente Staphylococcus aureus
Vergelijking van PCR en fenotypische methoden voor de detectie van methicillineresistente Staphylococcus aureus
Contexte et objectifs : La résistance à la méthicilline des souches résistantes à la méthicilline de Staphylococcus aureus (SARM) est due à la présence du gène mec-A , qui code pour une protéine de liaison à la pénicilline de faible affinité (PBP)-2a ou PBP2. L’identification précise et rapide du SARM dans les échantillons cliniques est essentielle pour une décision rapide sur un traitement efficace. L’objectif de l’étude était de comparer trois méthodes différentes de détection du SARM, à savoir la diffusion sur disque de céfoxitine, la gélose CHROM au SARM et la sensibilité à VITEK-2 avec la PCR, qui est la méthode de référence de référence, et de trouver le schéma de sensibilité aux antibiotiques de ces isolats par VITEK- 2.
Matériels et méthodes : Un complete de 100 isolats de S. aureus non en double ont été collectés à partir de différents échantillons cliniques parmi les sufferers ambulatoires et hospitalisés. La détection de MRSA parmi ces isolats a été effectuée par diffusion sur disque de céfoxitine , VITEK-2 , CHROM agar MRSA et PCR.
Résultats : La sensibilité et la spécificité de la diffusion sur disque de céfoxitine et de Vitek étaient de 97,2 % et 100 %, tandis que celles de la gélose CHROM étaient de 100 % et 78,6 %. La prévalence globale du SARM dans notre étude par PCR était de 72 %.
Conclusion : Sur la base des résultats de notre étude, les isolats qui présentent un diamètre de zone de céfoxitine < 22 mm peuvent être signalés comme SARM. Cependant, les isolats qui ont un diamètre de zone compris entre 22 et 24 mm devraient idéalement être confirmés par PCR.
Een snelle multiplex PCR-test voor soortidentificatie van Aziatische rijstplanthoppers (Hemiptera: Delphacidae) en de toepassing ervan op nimfen in het vroege stadium in rijstvelden
Le riz (Oryza sativa L.) est la principale tradition céréalière dans de nombreux pays asiatiques. Les cicadelles asiatiques du riz, Nilaparvata lugens (Stål) (cicadelle brune), Sogatella furcifera (Horváth) (cicadelle à dos blanc) et Laodelphax striatellus (Fallén) (petite cicadelle brune) (Hemiptera : Delphacidae), sont les ravageurs les plus importants sur le plan économique. de riz. Ces trois espèces de cicadelles du riz coexistent souvent dans la même rizière. Traditionnellement, l’identification des individus des trois espèces de cicadelles du riz repose sur des caractères morphologiques, mais la discrimination précise des nymphes des premiers stades est très difficile, même pour des chercheurs consultants. Dans cette étude, nous avons développé un take a look at PCR multiplex rapide en une étape utilisant l’ADNr 5.8S-ITS2 conservé et spécifique à l’espèce. amorces de gènes pour l’identification simultanée d’individus des trois espèces de cicadelles du riz.
Les résultats de la PCR multiplex ont montré que les trois espèces de cicadelles du riz pouvaient être identifiées avec précision en fonction de la longueur de l’amplicon résultant, quel que soit le stade de développement individuel. En outre, nous avons appliqué ce take a look at pour la première quantification précise des nymphes des premiers stades de chaque espèce de cicadelle de riz dans les rizières. Notamment, nous avons constaté que la composition spécifique des nymphes des premiers stades ne peut pas être extrapolée à partir de celle des adultes. Ainsi, le take a look at PCR multiplex développé ici facilite la détection de chaque espèce de cicadelle du riz au début des épidémies dans les rizières.
Description: This assay employs the competitive inhibition enzyme immunoassay technique. The microtiter plate provided in this kit has been pre-coated with PCr protein. Standards or samples are added to the appropriate microtiter plate wells then with a biotin-conjugated antibody specific to PCr. Next, Avidin conjugated to Horseradish Peroxidase (HRP) is added to each microplate well and incubated. After TMB substrate solution is added. The enzyme-substrate reaction is terminated by the addition of sulphuric acid solution and the color change is measured spectrophotometrically at a wavelength of 450nm ± 10nm. The concentration of PCr in the samples is then determined by comparing the OD of the samples to the standard curve.
Description: This assay employs the competitive inhibition enzyme immunoassay technique. The microtiter plate provided in this kit has been pre-coated with PCr protein. Standards or samples are added to the appropriate microtiter plate wells then with a biotin-conjugated antibody specific to PCr. Next, Avidin conjugated to Horseradish Peroxidase (HRP) is added to each microplate well and incubated. After TMB substrate solution is added. The enzyme-substrate reaction is terminated by the addition of sulphuric acid solution and the color change is measured spectrophotometrically at a wavelength of 450nm ± 10nm. The concentration of PCr in the samples is then determined by comparing the OD of the samples to the standard curve.
Description: This is Competitive Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of General Phosphocreatine (PCr) in serum, plasma and other biological fluids.
Description: This is Competitive Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of General Phosphocreatine (PCr) in serum, plasma and other biological fluids.
Description: This is Competitive Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of General Phosphocreatine (PCr) in serum, plasma and other biological fluids.
Description: This is Competitive Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of General Phosphocreatine (PCr) in serum, plasma and other biological fluids.
Description: Enzyme-linked immunosorbent assay based on the Competitive Inhibition method for detection of General Phosphocreatine (PCr) in samples from serum, plasma and other biological fluids with no significant corss-reactivity with analogues from other species.
Description: A competitive Inhibition ELISA kit for detection of Phosphocreatine from General in samples from blood, serum, plasma, cell culture fluid and other biological fluids.
Rétrospective observationele RT-PCR-analyses van 688 child’s van 843 SARS-CoV-2-positieve moeders, placenta-analyses en diagnostische analyses, beperkingen suggereren dat verticale transmissie mogelijk is
Query de recherche : y a-t-il une transmission verticale (de la mère au bébé pendant la période prénatale ou intrapartum) après une grossesse infectée par le SRAS-CoV-2 (COVID-19) ?
Conception de l’étude : une recherche systématique liée au SRAS-CoV-2 (COVID-19) , à la grossesse, aux issues néonatales, à la transmission virale et verticale. La durée était de décembre 2019 à mai 2020.
Résultats : Un complete de 84 études portant sur 862 femmes positives au COVID ont été incluses. Deux études avaient des grossesses en cours tandis que 82 études comprenaient 705 bébés, 1 fausse couche et 1 interruption médicale de grossesse (MTOP). La plupart des publications (50/84, 59,5%) ont signalé un petit nombre (<5) de bébés positifs. Sur 75 études, 18 bébés étaient positifs au COVID-19. Le premier take a look at diagnostique de réaction en chaîne par polymérase de transcription inverse (RT-PCR) a été effectué chez 449 bébés et 2 pertes, 2e RT-PCRa été effectué sur 82 bébés, des checks IgM ont été effectués sur 28 bébés et des checks IgG ont été effectués sur 28 bébés. Lors de la première RT-PCR, 47 études ont rapporté la durée des checks, tandis que 28 études ne l’ont pas fait. Des résultats positifs lors de la première RT-PCR ont été observés chez 14 bébés. Testé au plus tôt à la naissance et le temps moyen du résultat était de 22 heures. Trois bébés avec une première RT-PCR négative sont devenus positifs lors de la deuxième RT-PCR au jour 6, au jour 7 et à 24 heures, ce qui a continué à être positif à 1 semaine. Quatre études avec un complete de Four écouvillonnages placentaires étaient positives démontrant le SRAS-CoV -2 localisé dans le placenta. Dans 2 études, 10 checks de liquide amniotique étaient positifs pour le SRAS-CoV-2. Ces 2 bébés se sont révélés positifs à la RT-PCR lors de checks en série.
Conclusion : Les checks de diagnostic combinés à la période d’incubation et à la pathologie placentaire indiquent une forte probabilité qu’une transmission verticale intrapartum du SRAS-CoV-2 (COVID-19) de la mère au bébé soit doable.
Gevoeligheid van SARS-CoV-2 RNA-polymerasekettingreactie rencontré behulp van een klinische en radiologische referentiestandaard: Klinische gevoeligheid van SARS-CoV-2 PCR
Objectifs : Les checks de diagnostic du SRAS-CoV-2 sont importants pour l’épidémiologie , la gestion clinique et le contrôle des infections. Les limites de la sensibilité de la PCR oro-nasopharyngée en temps réel ont été décrites sur la base de comparaisons de checks uniques avec un échantillonnage répété . Nous avons évalué la sensibilité clinique de la PCR SARS-CoV-2 à l’aide d’une norme de référence clinique et radiologique.
Méthodes : Entre mars et mai 2020, 2060 sufferers ont subi une imagerie thoracique et un take a look at PCR SARS-CoV-2 . L’imagerie a été indépendamment signalée deux ou trois fois (en cas de discordance) par des radiologues en aveugle selon les critères radiologiques de COVID-19 . Nous avons exclu les sufferers asymptomatiques et ceux avec des diagnostics alternatifs qui pourraient expliquer les résultats de l’imagerie. Les associations avec la positivité de la PCR ont été évaluées par régression logistique binomiale.
Résultats : 901 sufferers présentaient des caractéristiques d’imagerie possibles/probables et des symptômes cliniques de COVID-19 et 429 sufferers répondaient à la définition de cas de référence clinique et radiologique. La sensibilité PCR du SRAS-CoV-2 était de 68 % (intervalle de confiance à 95 % 64-73), était la plus élevée 7 à eight jours après l’apparition des symptômes (78 % (68-88)) et était plus faible chez les fumeurs actuels (rapport de cotes ajusté 0,23 ( 0,12-0,42) p<0,001).
Conclusions : chez les sufferers présentant des caractéristiques cliniques et d’imagerie de COVID-19, la sensibilité du take a look at PCR était de 68 % et était plus faible chez les fumeurs ; une constatation qui pourrait expliquer les observations d’une incidence plus faible de la maladie et qui mérite une validation plus poussée. Les checks PCR doivent être interprétés en tenant compte de l’imagerie , de la durée des symptômes et du statut tabagique.
Vergelijking van microscopie en PCR voor detectie van Giardia Lamblia en Entamoeba Histolytica in monsters van menselijke ontlasting in een omgeving met beperkte middelen in West-Kenia
Contexte : Un diagnostic précis de Giardia lamblia et d’Entamoeba histolytica est necessary automotive ces parasites intestinaux représentent une proportion importante de la morbidité et de la mortalité dans le monde. La microscopie est le take a look at de diagnostic clé utilisé pour le diagnostic des deux parasites. D’autres checks, notamment des checks de diagnostic rapide et la réaction en chaîne par polymérase, ont été développés pour améliorer la détection de ces parasites. La plupart de ces nouveaux checks ne sont pas abordables dans les milieux aux ressources limitées, d’où la dépendance extreme à l’égard de la microscopie. L’objectif de cette étude était de déterminer la fiabilité de la microscopie dans un environnement aux ressources limitées dans l’ouest du Kenya, une région endémique pour les deux parasites intestinaux.
Méthodes : La réaction en chaîne par polymérase, le take a look at de référence, a été réalisée sur des échantillons de selles suspectés de détecter G. lamblia et E. histolytica. La microscopie a ensuite été réalisée sur les mêmes échantillons et les deux checks ont été comparés.
Résultats : La microscopie s’est avérée être 64,4 % wise, 86,6 % spécifique pour la détection de G. lamblia. De plus, ce take a look at était wise à 64,2 % et spécifique à 83,6 % pour le diagnostic d’E. histolytica. Les valeurs kappa de Cohen de 0,51 et 0,47 ont été déterminées pour la microscopie pour G. lamblia et E. histolytica respectivement. Le take a look at de McNemar a révélé une différence significative entre les deux checks, P<0,001.
Conclusion : Cette étude a révélé que la microscopie était un take a look at diagnostique fiable dans ce contexte aux ressources limitées.
Description: PHOSPHO2 Human Recombinant produced in E.coli is a single, non-glycosylated polypeptide chain containing 265 amino acids (1-241) and having a molecular mass of 30.3kDa.;PHOSPHO2 is fused to a 24 amino acid His-tag at N-terminus & purified by proprietary chromatographic techniques.
PHOSPHO1 Phosphatase Orphan-1 Human Recombinant Protein
Description: Human Phospho1 Recombinant produced in E.Coli is a single, non-glycosylated, polypeptide chain containing 295 amino acids and having a molecular mass of 31.3 kDa. The Human Phospho1 is fused to a 14 aa His tag at N-Terminus. Human Phosphocholine Phosphatase is purified by proprietary chromatographic techniques.
